Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms