Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mre11Q61216 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms