Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mdc1Q5PSV9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mdc1Q5PSV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms