Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms