Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc10Q3TLI0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc10Q3TLI0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms