Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TfamP40630 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TfamP40630 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TfamP40630 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms