Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1476.1 ms