Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms