Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NelfeP19426 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NelfeP19426 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NelfeP19426 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms