Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NclP09405 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NclP09405 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NclP09405 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NclP09405 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NclP09405 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NclP09405 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NclP09405 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NclP09405 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NclP09405 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NclP09405 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NclP09405 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NclP09405 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NclP09405 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NclP09405 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NclP09405 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NclP09405 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NclP09405 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NclP09405 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms