Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamc1P02468 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamc1P02468 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms