Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01725 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01725 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01725 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01725 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01725 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01725 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01725 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01725 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms