Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01668 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01668 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01668 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01668 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01668 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01668 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01668 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01668 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01668 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01668 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01668 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01668 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01668 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms