Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BsnO88737 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BsnO88737 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BsnO88737 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BsnO88737 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BsnO88737 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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