Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dll3O88516 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dll3O88516 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms