Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Efna3O08545 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efna3O08545 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms