Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd4b4J3QNS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms