Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbip1J3QMK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms