Protein–RNA interactions for Protein: J3QK25

G530012D18Rik, RIKEN cDNA G530012D1 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G530012D18RikJ3QK25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
G530012D18RikJ3QK25 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
G530012D18RikJ3QK25 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms