Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm8444F6XS56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms