Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms