Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms