Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col9a3A2ACT7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms