Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933424G06RikA0A140LIP3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms