Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt71Q9R0H5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krt71Q9R0H5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt71Q9R0H5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krt71Q9R0H5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms