Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col5a3Q9JLI2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Col5a3Q9JLI2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col5a3Q9JLI2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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