Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkrip1Q9CWV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkrip1Q9CWV6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prkrip1Q9CWV6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prkrip1Q9CWV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkrip1Q9CWV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkrip1Q9CWV6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms