Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms