Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dkk4Q8VEJ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dkk4Q8VEJ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms