Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TmieQ8K467 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TmieQ8K467 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms