Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atad2Q8CDM1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atad2Q8CDM1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atad2Q8CDM1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.8 ms