Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc30Q8BVF4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms