Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik4Q8BMF5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms