Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ptx4Q6RUU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms