Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm29Q6PDI5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm29Q6PDI5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ecm29Q6PDI5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ecm29Q6PDI5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm29Q6PDI5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm29Q6PDI5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm29Q6PDI5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms