Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2surpQ6NV83 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms