Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NipblQ6KCD5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NipblQ6KCD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms