Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9aQ68FE2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg9aQ68FE2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms