Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knl1Q66JQ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Knl1Q66JQ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Knl1Q66JQ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms