Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic3Q62521 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms