Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdc1Q5PSV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdc1Q5PSV9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms