Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms