Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm10Q3UTQ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm10Q3UTQ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms