Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms