Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Brf2Q3UAW9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brf2Q3UAW9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms