Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cmklr1P97468 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms