Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psme1P97371 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme1P97371 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psme1P97371 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme1P97371 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psme1P97371 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms