Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp1P29452 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp1P29452 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp1P29452 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms