Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kif3aP28741 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms