Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BsnO88737 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BsnO88737 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BsnO88737 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BsnO88737 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BsnO88737 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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